日本扁柏（原变种）：乔木，在原产地高达40米；树冠尖塔形；树皮红褐色，光滑，裂成薄片脱落；生鳞叶的小枝条扁平，排成一平面。鳞叶肥厚，先端钝，小枝上面中央之叶露出部分近方形，长1-1.5毫米，绿色，背部具纵脊，通常无腺点，侧面之叶对折呈倒卵状菱形，长约3毫米，小枝下面之叶微被白粉。雄球花椭圆形，长约3毫米，雄蕊6对，花药黄色。球果圆球形，径8-10毫米，熟时红褐色；种鳞4对，顶部五角形，平或中央稍凹，有小尖头；种子近圆形，长2.6-3毫米，两侧有窄翅。花期4月，球果10-11月成熟。

云片柏（栽培变种）：小乔木，树冠窄塔形；枝短，生鳞叶的小枝薄片状，有规则地排列，侧生片状小枝盖住顶生片状小枝，如层云状；球果较小。（《中国植物志》）