公元8世纪，唐天宝年间，于阗古代维吾尔名医比吉·赞巴·希拉汗应聘入西藏，担任王室侍医，曾将自己所着《医学宝鉴》《伤寒解义》《尸体图览》《甘露宝鉴》等10余种医书译成藏文献给藏王。藏王赤德祖赞(704～754年在位)令人将书集中收藏，统一命名为《王室养生保健全书》。吐蕃王朝第五代藏王赤松德赞(754～797年在位)即位后，继续以重金延聘各国名医入藏传授医术，编译医药着作，发展藏医药学。希拉汗曾与他人合写《汉地脉诊妙法》《消肿神方》《放血铁莲》《穿刺巧术》《养身晶珠》等30多部医药着作。他告老返回于阗前曾将有关人体解剖测量的书籍和包括诸论治疗，切脉秘诀等内容的医学巨着《黄色比吉经函》一起献给藏王。这些维医药着作对后来的藏医名着《四部医典》的产生起了很大的作用。9世纪中叶后期，生活在中国漠北的维吾尔族一部回纥，由于回纥汗国遭受饥荒和疾病，经济濒于崩溃，又为黠嘎斯所破，其大部分西迁，同原来就居住在新疆广大地区操焉耆、龟兹、于阗语的回鹘融合。公元9世纪左右的《回鹘医学文献》是反映当时高昌(今吐鲁番)回鹘王朝医学的珍贵资料，其内容毛括临床各科疾病、治疗及药方，疗法包括食疗、药疗、理疗、冷热敷、灸烙、放血、穿刺、清理伤口、骨折夹板固定、水疗、日疗及精神疗法；药物中牛角、尿、乳汁、羚羊角、斯迪系……牛、马、狼、人和兔胆汁、麝香、海狸香、硇砂、胡杨胶、桑椹干、柴白檀香、葡萄醋、黑胡椒、芝麻、蒜和自铅粉等。隋唐时代，古代维吾尔医药曾经兴盛一时，远传至西安和东南沿海口岸。扬州是当时的商业城市，西域的僧侣、商人也络绎不绝来到扬州。扬州高僧鉴真和尚为到日本去传教，因几次渡海失败，患眼疾失明，多方医治无效，后来曾请到一位西域回鹘医生给他做了手术后痊愈，重新起航去日本顺利地进行传教。由此可见，当时维医也有相当高的外科手术技术。维吾尔着名科学家、哲学家、天文学家、医学家法拉比(公元870～950年)有关医学的着作有十几部，有《论自然界》《论人体学》《论神经学》《器官的功能》《论自然物的热性、寒性、湿性、干性》等。他以四大物质(四要素)学说论证了自然界和人体生理、病理的变化关系。这不但对推动回鹘医学发展起了重要作用，而对他的间接学生伊本·西拿的《大医典》，甚至阿拉伯、中亚医学产生了巨大影响。

10世纪新疆处于喀拉汗王朝时期，维族开始信奉伊斯兰教，为此新疆阿图什设立了“麦德日斯·萨其也”(放光)学堂，它是包括医学专科在内的综合性科学院校。该校最着名的维医外科学家伊麻都丁·喀什格日是受人民尊敬的医师，他多次奔赴战场成功的完成了各种外科手术，他高超的医技和人道主义精神，博得了国王博格拉汗的恩赐，奖给了战马和战刀。他着《注大医典》《中国菝葜》等专着。虽然，维吾尔族由于喀拉汗王朝中期开始使用阿拉伯字母的察哈台文，许多回鹘文医着未能保存下来，但从当时的《福乐智慧》《突厥语大词典》及元代以后维医专着可验证有关回鹘医学大量资料。麻赫穆德·喀格里(1020～1080年)的《突厥语大词典》中记载的临床各科疾病，疗法及处方用药的格调与《回鹘医学文选》一脉相承，如：“给狂犬咬伤的人，服疯狗的脑就会好”，“对夜尿症，用骆驼肉和大麦混做饭，食用就愈”、“若牙疼，硼砂、麝香混合放在牙上”等上百种疗法及药名。《福乐智慧》的作者优素甫·哈斯·哈吉甫(1009～1070年)不但以长诗形式颂叙了喀拉汗王朝时期的政治、经济、文化繁荣发展的崭新面貌，同时又用医学思想阐述了人的生、老、病、死与自然界四要素(火、气、水、土)及人体气质、体液(胆液质、血液质、粘液质、黑胆质)的平衡有着密切的关系并介绍其治疗总则及20种剂型名称。12世纪初，西辽政权统治新疆至蒙古时期，和田一位着名的维医学家阿老丁·穆罕木德·和田尼(1150 1222年)着。Zubdatul Kawanil Ilaj(治疗精华)”及“Tibbi Fitki(法医)”，手抄本一直流传至今。同一时期，维吾尔医名医贾马力丁·阿克萨依出生在和田墨玉县阿克萨依村，他以本村名命名的维医专着《阿克萨依》于1899年在印度勒克瑙城正式出版，同时作为印度首都德里的伊斯兰医学院正式教材用到1929年。该书包括：维医基础理论、各科疾病及其治疗、药物及方剂等，是一部国内外享有很高声誉的维医药名着。

元代的统治阶级为了让更多的维吾尔(回鹘、回回、畏兀儿、哈喇鲁)人参政，并满足他们的要求，对回回医学也很重视，在大都和上都均设回回药物院，维药学家答里麻在1307年(仅19岁)任该院达鲁花赤(院长)，回回药物院扩建为广惠司后，回鹘外科医生聂只耳是任该司的令君。据库车17世纪维吾尔名医《西日甫·本·佳马力丁·阿吉传》记载：库车着名维医药学家胡都优木汗·阿吉(1567～1658)1619年参与《回回药方》36卷的编撰工作。据住在合州钓鱼山(四川合州)县行医的着名军医赤海牙和布鲁米希的儿子医师爱薛(1247～1318年)，均是元代维吾尔名医。《苏拉赫(明净)》是维吾尔科学家贾马勒·卡尔西(？～1322年)在喀什用波斯文撰写的维医学词汇为主的自然、地理、气象词典。同一时期居住在中原的维吾尔药学家萨德弥实有专着《瑞竹堂经验方》。维医营养学家忽思慧撰写的《饮膳正要》是中国古代一部饮食卫生与营养学专着(关于萨德弥实和忽思慧的族别，目前尚有争论——本书主编)。和田维吾尔名医毛拉·阿日甫(1556～1662年)着《Dasturul Ilaj》(医疗指南)；明清时期，维医药学知识在汉族中医药着作中有了更多的反映。如：明代的《本草纲目》中记载：阿魏、茜草、硇砂、胡黄连、胡麻、胡桃、胡葱、菠萝、茴香、红花、荜茇、刺糖、腽肭脐、腽肭兽、返魂香、大尾羊、黄羊、驼、酪、醍醐、羚羊角、金、玉、玛瑙等100多种。也有众多维医名医着作问世，如：17世纪维吾尔名医木拉德。拜克着《Agiraz Tibbi》(医学之目的)，18世纪莎车名医毛拉那·赛衣非的《木排日勒·库鲁比》，还有19世纪穆罕木德·热依木·沙·布瓦的《满百依·福瓦依》，赛依德·穆合塔尔·布拉克·拜克的《提比·西法》，霍加·热衣木·阿洪的《提比·充》，奥斯满·拜克的《夏拉依提·斯海提》，木拉德·拜克的《塔吉日巴提·提比也》，毛拉·玉素甫的《特日库力·依拉吉》，买买提明的《孜亚奥力·库鲁甫》及喀什名医拜德尔丁·苏皮·阿洪的《Xifail Kulub》(如意疗法)，等等。