黎族族群的形成距今约6000多年，而汉族族群的形成距今只有5000多年。可见，黎族医药的发展历史悠久。关于黎族医药的历史，由于黎族没有本民族的文字，无法记载，而汉文字的史籍有关资料也记载甚少，因此无法考证。原苏联学者巴甫洛夫曾经说过，“有了人类的出现，就有了医的活动”。我国甄志亚主编的《中国医学史》作为高等医学院校教学考参书，其中也提到“有了人类，就有了卫生保健活动”。人类的医学史可以归纳为三个时代，六种医学模式。三个时代为:经验医学时代、实验医学时代和整体（系统）医学时代。六种医学模式为：神灵主义的医学模式、自然哲学的医学模式、机械论的医学模式、生物医学模式、社会生态医学模式及生物一心理一社会医学模式。

黎族医学的医学模式为神灵主义的医学模式，自然哲学的医学模式及机械论的医学模式相互并存、交叉。这种模式是由黎族的生产力所决定的。过去，黎族居住的绝大部分地区处于原始或半原始社会时代，保留原始氏族公社的合亩制，传统经济以“刀耕火种”（砍山兰）的种植方式，并以狩猎为主，过着男耕女织，自给自足的自然经济生活。

黎族信奉世间万物有“灵气”，盛行图腾崇拜、自然崇拜等。黎族的崇神医学，主要是崇拜和继承祖先采用的杀牲祭神、避邪驱鬼等巫术的求医治病方式。如发热头痛，用米卜，通过法术查明为“灶炉鬼”作祟，需杀猪祭祀；如肚子痛、呕吐腹泻症，认为是“风鬼”作祟，需杀鸡祭祀；急性风症，是“风火山鬼”作祟，急需杀黄牛祭祀；妇女难产症，为“无头鬼”作祟，需杀羊祭祀；突然昏倒不省人事之症，为“龙水鬼”作祟，需杀白鸡一只、水蛇一条祭祀，还需要画卦符贴在门口和周围树木上。宋代乐史的《太平寰宇记》记载：“俚(黎）人以草药治疗跌打损伤及疮疖，疮毒外科一切杂症，每有奇效。然亦以迷信出之。予尝见一患病者，俚仁老治疾，其人到病家里以公鸡一只，小尖刀一把，酒、水、米饭，诸项陈列于堂，求者先取尖刀纳袋中，脱草覆于地，取火刀念咒，喷患处，操刀割之，脓血并流，而病者无痛苦，脓尽后，敷药而愈。”这是古文献对黎族巫医治疗疾病的详细记载，完全体现神灵主义的医学模式。而黎医中的阴阳概念、药物的生长及利用都恰恰反映了黎族的自然哲学的医学模式。黎医的机械论的医学模式表现为对疾病的认识及其施治过程，如黎族的槟榔果煮水治疗肠道寄生虫病、骨刺破痈排脓。这种巫术与药物并用，科学与谬误交织是黎医的最显著特点。因此，黎医的医学模式是神灵主义的医学模式、自然哲学的医学模式及机械论的医学模式交叉并存的医学模式，这种独特的医学模式，为我们了解、研究黎族医药提供了很大的帮助。随着社会的发展，文化和科学知识的普及，黎医对疾病防治也有了新的科学认识，黎族医学逐步摆脱巫术的束缚，以植物为主的药物疗法成为疾病防治的主要手段。黎族从神灵主义医学模式逐步向药物医学模式转变将是必然的规律。

黎族医学发展史，可分为三个阶段，第一阶段为原始自然进化阶段，以巫医、咒医为主，草药为辅；第二阶段为黎族医学受外来医学影响阶段，自隋唐至明清朝代大量汉人的迁人同时带入的祖国传统医学，以及随西方传教士带来的西方医学；第三阶段为现代医学时期,解放后，党和政府对黎族医疗卫生事业十分重视，从医疗机构的设置、医疗人员的培训，到疾病的控制和预防，从药政管理到药品开发，从妇幼保健到计划生育，优生优育，以及爱国卫生运动的开展等方面都做了大量的工作，使黎族地区的医疗卫生发生了很大的变化。